なお、手持ちのSuicaカードでも、iPhone 7に取り込めないものもある。ビュー・スイカなど、クレジットカード一体型Suica、小児用のMy Suica、ゆうちょなどのキャッシュカード一体型Suica、社員証や学生証と一体型のSuica、高校生以下の通学用Suica定期券、JR東以外で発売されたSuicaやICカード(PASMOやICOCAなど)だ。このほか、SF(電子マネー)の残額が19,501円以上のSuicaカードも取り込めない。
また、Apple Payで利用できないSuicaサービスとしては、EX-IC(JR東海の指定席予約サービス)、ネット決済(ネットショッピングの支払い)、銀行チャージ(銀行口座からの入金)、キャリア決済チャージ(携帯電話会社のっキャリア決済サービスによる入金)などがある。
